Las mitocondrias fueron en su día bacterias de vida libre que fueron absorbidas por las células
La teoría endosimbiótica, confirmada por Lynn Margulis en la década de 1960 y ahora universalmente aceptada, sostiene que las mitocondrias — las centrales eléctricas de las células eucariotas — eran en su día alfaproteobacterias independientes que fueron engullidas por una célula ancestral hace aproximadamente 1.500 millones de años. En lugar de ser digeridas, formaron una asociación mutuamente beneficiosa. Evidencia: las mitocondrias tienen su propio ADN circular, se dividen por fisión binaria y tienen membranas dobles — todas características de ascendencia bacteriana.