Les îles abritent un oiseau endémique et en danger critique d'extinction
Le râle des Cocos (Gallirallus philippensis andrewsi) est une sous-espèce que l'on ne trouve que sur l'île de North Keeling, ayant disparu de South Keeling. Sa survie dépend entièrement de l'environnement immaculé et sans prédateurs du parc national.